ترتكز جمعية سعف للإسكان التنموي على نظام رقابة داخلي لتقيیم السیاسات والإجراءات المتعلقة بإدارة المخاطر، وتطبیق أحكام قواعد الحوكمة الخاصة بالجمعیة والتي تم اعتمادها من قبل وزارة الموارد البشرية والتنمیة الاجتماعیة،والتقید بالأنظمة واللوائح ذات الصلة.